Selectie signaturen in geselecteerde Poolse paarden
Selectief fokken bij paarden heeft geresulteerd in een verscheidenheid aan waarneembare kenmerken, het fenotype. Sinds de domesticatie van paarden waren selectie criteria gericht op het verbeteren van paarden voor gebruik in transport, landbouw en paardrijden.
Hedendaags is selectie meestal gericht op verbetering van het uiterlijk en prestatiekenmerken, waarbij vaak binnen rassen een grote uniformiteit kan worden waargenomen. Recente ontwikkelingen in genotyperingsmethoden creëerden de mogelijkheid om regio's op het genoom te bestuderen die zijn beïnvloed door selectie. Het doel van deze studie was om selectie signaturen te identificeren in zes verschillende paardenrassen.
De studie werd uitgevoerd aan de hand van een waarde voor locus specifieke allelfrequentie variatie om populatie differentiatie te identificeren. De rassen waren verdeeld in drie categorieën: lichte paarden (Arabisch en Malopolski), primitieve rassen (Poolse Konik en Hucul) en trekpaarden (Sokolski en Sztumski).
De resultaten gaven verschillende selectiesignalen, regio's en genen die verband houden met processen, zoals: energiehomeostase tijdens lichamelijke inspanning, hartfunctie, vruchtbaarheid, ziekteresistentie en motorische coördinatie. Allemaal potentieel belangrijk voor fenotypische differentiatie tussen rassen. Bovendien werden twee loci geïdentificeerd die lichaamsafmetingen reguleren bij trek- en primitieve paarden. In de Poolse Konik werd een selectiesignaal geïdentificeerd op de locus van een eerder geïdentificeerd gen, waarvan is aangetoond dat het verantwoordelijk is voor de dun vachtkleur in andere paardenrassen.
Oordeel van deskundige: Anouk van Breukelen
Verdere functionele en vergelijkende studies zijn nodig om de resultaten te bevestigen en het effect op de diversiteit in de rassen te observeren.
> Van: Gurgul et al., PLOS One 14 (2019) e0210751. Alle rechten voorbehouden aan Creative Commons Attribution License. Bekijk hier de online samenvatting van de publicatie.